Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNHIT3Q15649 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNHIT3Q15649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms