Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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