Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRADDQ15628 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRADDQ15628 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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