Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR1Q15399 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR1Q15399 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR1Q15399 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms