Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK3Q15120 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK3Q15120 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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