Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HERC3Q15034 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC3Q15034 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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