Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD1Q15011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERPUD1Q15011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms