Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR1I3Q14994 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1I3Q14994 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1I3Q14994 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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