Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB39AQ14964 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RAB39AQ14964 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39AQ14964 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RAB39AQ14964 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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RAB39AQ14964 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39AQ14964 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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