Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-7■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 MARCH6-214ENST00000606497 1334 ntTSL 48.09□□□□□ -1.112e-10■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 28.18□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 17.6
PUM1Q14671 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-8■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-8■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 CAST-232ENST00000510500 1835 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 CAST-209ENST00000437034 3377 ntTSL 1 (best)5.32□□□□□ -1.562e-7■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-7■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-11■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 57.29□□□□□ -1.242e-7■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 POLR2A-206ENST00000576553 602 ntTSL 221.47■■□□□ 1.034e-14■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)21.43■■□□□ 1.023e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 519.68■□□□□ 0.743e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.743e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 518.07■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 17.5
PUM1Q14671 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.524e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.624e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.74e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.734e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-7■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 516.88■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 MIA3-209ENST00000476400 435 ntTSL 34.18□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 17.4
PUM1Q14671 NUDC-202ENST00000435827 821 ntTSL 523.71■■□□□ 1.392e-10■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 SUDS3-202ENST00000541280 659 ntTSL 56.8□□□□□ -1.323e-7■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.527e-7■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 216.53■□□□□ 0.247e-7■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-7■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-7■■■□□ 17.3
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PUM1Q14671 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-8■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 FAM50A-203ENST00000464419 1470 ntTSL 523.5■■□□□ 1.355e-8■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-8■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.893e-9■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-9■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.4■□□□□ 0.543e-9■■■□□ 17.3
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PUM1Q14671 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 516.51■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-9■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-9■■■□□ 17.3
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PUM1Q14671 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-9■■■□□ 17.3
PUM1Q14671 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-27■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.621e-27■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.651e-8■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.291e-6■■■□□ 17.2
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PUM1Q14671 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.257e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 216.5■□□□□ 0.237e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.14■□□□□ 0.177e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.127e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 414.07□□□□□ -0.167e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-6■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-6■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 512.52□□□□□ -0.417e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 511.04□□□□□ -0.647e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.24□□□□□ -0.777e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.278e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-41■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-41■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 212.14□□□□□ -0.471e-41■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-41■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.075e-6■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.175e-6■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 IQGAP1-217ENST00000561461 720 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 IQGAP1-206ENST00000559674 550 ntTSL 35.81□□□□□ -1.483e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-13■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-15■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.741e-15■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 517.07■□□□□ 0.327e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 416.84■□□□□ 0.297e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 514.3□□□□□ -0.127e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 414.04□□□□□ -0.167e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 513.81□□□□□ -0.27e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.277e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.367e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.457e-7■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 221.11■□□□□ 0.978e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 311.07□□□□□ -0.648e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-219ENST00000442714 569 ntTSL 411.03□□□□□ -0.648e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-221ENST00000444092 598 ntTSL 210.98□□□□□ -0.658e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 510.96□□□□□ -0.658e-11■■■□□ 17.2
PUM1Q14671 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 510.45□□□□□ -0.748e-11■■■□□ 17.2
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