Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF3Q14653 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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