Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA9Q13797 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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ITGA9Q13797 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA9Q13797 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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