Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPBGQ13641 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms