Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.113e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-222ENST00000621217 4181 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 GGA3-218ENST00000584243 646 ntTSL 37.28□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 23.2
TRA2AQ13595 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 523.72■■□□□ 1.394e-13■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 312.83□□□□□ -0.364e-13■■■■□ 23.1
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TRA2AQ13595 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 59.86□□□□□ -0.834e-13■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 53.47□□□□□ -1.854e-13■■■■□ 23.1
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TRA2AQ13595 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.346e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.146e-14■■■■□ 23.1
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TRA2AQ13595 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.266e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 55.75□□□□□ -1.496e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-214ENST00000513373 546 ntTSL 24.4□□□□□ -1.716e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 54.18□□□□□ -1.746e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 43.73□□□□□ -1.816e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 SEPT11-215ENST00000513697 328 ntTSL 23.2□□□□□ -1.96e-14■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 23.1
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TRA2AQ13595 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-7■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 HBP1-204ENST00000463790 433 ntTSL 56.14□□□□□ -1.431e-7■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 HBP1-202ENST00000461963 581 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-7■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 HBP1-203ENST00000463202 2646 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.661e-7■■■■□ 23.1
TRA2AQ13595 HBP1-215ENST00000607681 476 ntTSL 23.14□□□□□ -1.911e-7■■■■□ 23.1
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TRA2AQ13595 CLK1-204ENST00000432425 1682 ntTSL 1 (best)2.69□□□□□ -1.982e-9■■■■□ 22.8
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TRA2AQ13595 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 22.6
TRA2AQ13595 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 22.6
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TRA2AQ13595 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 22.6
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TRA2AQ13595 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.013e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-220ENST00000569266 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.723e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-202ENST00000389447 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-213ENST00000566403 1396 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 FAM192A-211ENST00000565956 618 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.167e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.437e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-12■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.77e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -17e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.477e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 53.35□□□□□ -1.877e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 47.75□□□□□ -1.179e-15■■■■□ 22.5
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