Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRF5Q13568 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRF5Q13568 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IRF5Q13568 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
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