Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf61Q13536 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf61Q13536 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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