Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1AQ13111 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHAF1AQ13111 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1AQ13111 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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