Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFSWAPQ12872 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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