Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ADE2YOR128C 1716 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 PDC6YGR087C 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 SNU66YOR308C 1764 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 CPR1YDR155C 489 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 CIR1YGR207C 786 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 LIN1YHR156C 1023 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 BET4YJL031C 984 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 YJR142WYJR142W 1029 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 YAR030CYAR030C 342 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 DUS4YLR405W 1104 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 PRS4YBL068W 981 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 DUG3YNL191W 1074 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 KTR1YOR099W 1182 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 YPL264CYPL264C 1062 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 ADH5YBR145W 1056 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 PEX32YBR168W 1242 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 ITT1YML068W 1395 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 EHT1YBR177C 1356 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 SMP1YBR182C 1359 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BLQ12266 SER3YER081W 1410 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YPR196WYPR196W 1413 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CLN2YPL256C 1638 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 DIP5YPL265W 1827 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RMD1YDL001W 1293 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SWM1YDR260C 513 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CAK1YFL029C 1107 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YGR042WYGR042W 816 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 TDA4YJR116W 840 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 REC102YLR329W 795 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SEC14YMR079W 915 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YNL013CYNL013C 378 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YOR238WYOR238W 912 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 snR19snR19 568 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 AI4Q0065 1671 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 COR1YBL045C 1374 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YCR001WYCR001W 315 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 MSS2YDL107W 1056 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RSM28YDR494W 1086 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 PAD1YDR538W 729 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 HSP150YJL159W 1242 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RIM11YMR139W 1113 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YMR166CYMR166C 1107 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 NOP13YNL175C 1212 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SLG1YOR008C 1137 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RPB8YOR224C 441 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 OLA1YBR025C 1185 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YPL102CYPL102C 303 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YPL108WYPL108W 507 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ALG14YBR070C 714 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 MAM3YOL060C 2121 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 PRP19YLL036C 1512 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 DXO1YDR370C 1329 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 BEM1YBR200W 1656 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YJL068CYJL068C 900 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CBF1YJR060W 1056 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YOR111WYOR111W 699 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 HUA2YOR284W 732 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SPO19YPL130W 672 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ENV7YPL236C 1095 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CNM67YNL225C 1746 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YIL001WYIL001W 1542 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ICL2YPR006C 1728 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 NSA2YER126C 786 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 DOG2YHR043C 741 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 DOG1YHR044C 741 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 GIC1YHR061C 945 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 PEP8YJL053W 1140 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 HRT3YLR097C 1035 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ERG27YLR100W 1044 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SHC1YER096W 1539 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SGF73YGL066W 1974 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 HXT9YJL219W 1704 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ATP16YDL004W 483 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 snR83snR83 306 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 ATG38YLR211C 681 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 HSH49YOR319W 642 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 LSP1YPL004C 1026 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RHO1YPR165W 630 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CSH1YBR161W 1131 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 UMP1YBR173C 447 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RRT2YBR246W 1164 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SAM50YNL026W 1455 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 CLG1YGL215W 1359 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 LPL1YOR059C 1353 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SRB5YGR104C 924 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SYS1YJL004C 612 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 SNX4YJL036W 1272 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 MNN11YJL183W 1269 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YNL146WYNL146W 303 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YOR225WYOR225W 330 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RBD2YPL246C 789 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 YER152CYER152C 1332 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 BCS1YDR375C 1371 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-BLQ12266 RRP43YCR035C 1185 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 PPH3YDR075W 927 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YER084W-AYER084W-A 513 nt6.96□□□□□ -1.3
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