Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 BSC5YNR069C 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 RPT6YGL048C 1218 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 VPS24YKL041W 675 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 TSA1YML028W 591 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YMR252CYMR252C 405 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 FRS2YFL022C 1512 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 APE1YKL103C 1545 nt5.64□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YHR095WYHR095W 495 nt5.63□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.63□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SEG2YKL105C 3399 nt5.63□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 CRF1YDR223W 1404 nt5.63□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SNF3YDL194W 2655 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PMA1YGL008C 2757 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 EAF5YEL018W 840 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 URA3YEL021W 804 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YER084WYER084W 387 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 RPN11YFR004W 921 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 POR2YIL114C 846 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YKL153WYKL153W 510 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SCP1YOR367W 603 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 NHA1YLR138W 2958 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 MDM31YHR194W 1740 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SEC9YGR009C 1956 nt5.62□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 DAL81YIR023W 2913 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 UPS3YDR185C 540 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YEL068CYEL068C 333 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 LDS1YAL018C 978 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YMD8YML038C 1329 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YHM2YMR241W 945 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 ELC1YPL046C 300 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 GPR1YDL035C 2886 nt5.61□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 OSW2YLR054C 2175 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PDR18YNR070W 4002 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 GAT1YFL021W 1533 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 KCH1YJR054W 1494 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YET3YDL072C 612 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 AIM20YIL158W 615 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YPR114WYPR114W 948 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PRP43YGL120C 2304 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 MCM3YEL032W 2916 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PRP40YKL012W 1752 nt5.6□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 SMF2YHR050W 1650 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 CDC1YDR182W 1476 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PKC1YBL105C 3456 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PXA1YPL147W 2613 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 ASP1YDR321W 1146 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YER187WYER187W 426 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 PFA3YNL326C 1011 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 YNR040WYNR040W 771 nt5.59□□□□□ -1.51
NFI1Q12216 UGO1YDR470C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 DBF2YGR092W 1719 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MAK31YCR020C-A 267 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 RPS16BYDL083C 432 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 RPL10YLR075W 666 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 HLJ1YMR161W 675 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ADD37YMR184W 597 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YNL194CYNL194C 906 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 SCS22YBL091C-A 528 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MED4YOR174W 855 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MRPS16YPL013C 366 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 RAD3YER171W 2337 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 PRT1YOR361C 2292 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ARB1YER036C 1833 nt5.58□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YEL077CYEL077C 3834 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YJU3YKL094W 942 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YMR122CYMR122C 375 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 BAP2YBR068C 1830 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ATG4YNL223W 1485 nt5.57□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 GIP1YBR045C 1920 nt5.56□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 GAS3YMR215W 1575 nt5.56□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 PHB1YGR132C 864 nt5.56□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YOR111WYOR111W 699 nt5.56□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ENT2YLR206W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 SKI6YGR195W 741 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MID2YLR332W 1131 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 TAL1YLR354C 1008 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 HAP3YBL021C 435 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 SCS7YMR272C 1155 nt5.55□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 CPS1YJL172W 1731 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MSP1YGR028W 1089 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 TDH2YJR009C 999 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 BUB3YOR026W 1026 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 GCR2YNL199C 1605 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 MSC7YHR039C 1935 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 YGR125WYGR125W 3111 nt5.54□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 TFG2YGR005C 1203 nt5.53□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 CAF40YNL288W 1122 nt5.53□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ICL1YER065C 1674 nt5.53□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 SSY5YJL156C 2100 nt5.53□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 UBP9YER098W 2265 nt5.53□□□□□ -1.52
NFI1Q12216 ATR1YML116W 1629 nt5.52□□□□□ -1.53
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