Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CPSF1Q10570 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CPSF1Q10570 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
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