Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF543Q08ER8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF543Q08ER8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF543Q08ER8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms