Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 YPR114WYPR114W 948 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 TUL1YKL034W 2277 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 CTS2YDR371W 1536 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 MNN5YJL186W 1761 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 TEP1YNL128W 1305 nt5.47□□□□□ -1.53
FMP40Q08968 NSI1YDR026C 1713 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 RPL7AYGL076C 735 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 VTH1YIL173W 4650 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 VTH2YJL222W 4650 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 ZRT2YLR130C 1269 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 PDR16YNL231C 1056 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 DSE3YOR264W 1293 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 RPL7BYPL198W 735 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 IFA38YBR159W 1044 nt5.46□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 VPS70YJR126C 2436 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 YDL129WYDL129W 876 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 SNN1YNL086W 309 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 YOL035CYOL035C 303 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 NAT5YOR253W 531 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 VPS4YPR173C 1314 nt5.45□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 HST4YDR191W 1113 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 CWC21YDR482C 408 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 KKQ8YKL168C 2175 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 ENV7YPL236C 1095 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 SFB3YHR098C 2790 nt5.44□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 VRP1YLR337C 2454 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 KEX2YNL238W 2445 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 MMS2YGL087C 414 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 CTR2YHR175W 570 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 ATG4YNL223W 1485 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 OXP1YKL215C 3861 nt5.43□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 DBP9YLR276C 1785 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 RAD24YER173W 1980 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 PHB1YGR132C 864 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 MCM3YEL032W 2916 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 LYS21YDL131W 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 ADE12YNL220W 1302 nt5.42□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 MDH3YDL078C 1032 nt5.41□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 GAT1YFL021W 1533 nt5.41□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 NUP1YOR098C 3231 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 FRS2YFL022C 1512 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 IMG2YCR071C 441 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 SIT4YDL047W 936 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 IPK1YDR315C 846 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 PHM8YER037W 966 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 AAD6YFL056C 639 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 RPN11YFR004W 921 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 LEU5YHR002W 1074 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 RPE1YJL121C 717 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 OSW5YMR148W 447 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 NRM1YNR009W 750 nt5.4□□□□□ -1.54
FMP40Q08968 BUD14YAR014C 2130 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 RKM4YDR257C 1485 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 HIR1YBL008W 2523 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 RPR2YIR015W 435 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YKL223WYKL223W 333 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 ECM19YLR390W 339 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 SPO77YLR341W 1434 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 FRE7YOL152W 1863 nt5.39□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 PRI2YKL045W 1587 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 PIC2YER053C 903 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YNR040WYNR040W 771 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YPL014WYPL014W 1146 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 MRPS5YBR251W 924 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 NTH2YBR001C 2343 nt5.38□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 TAX4YJL083W 1815 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 VMA4YOR332W 702 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 snR32snR32 188 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 UBA1YKL210W 3075 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 PCL10YGL134W 1302 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 CLD1YGR110W 1338 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 NUD1YOR373W 2556 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 MNS1YJR131W 1650 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 HXT5YHR096C 1779 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 MAL11YGR289C 1851 nt5.37□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 ACS2YLR153C 2052 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YJL193WYJL193W 1209 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 YKR075CYKR075C 924 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 ADD37YMR184W 597 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 UIP4YPL186C 915 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 CLP1YOR250C 1338 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 TRP3YKL211C 1455 nt5.36□□□□□ -1.55
FMP40Q08968 GSY2YLR258W 2118 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms