Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGM3Q08188 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGM3Q08188 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms