Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 512.54□□□□□ -0.46e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 39.32□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-210ENST00000470797 909 ntTSL 28.88□□□□□ -0.996e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-209ENST00000463049 6102 ntTSL 57.92□□□□□ -1.146e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.316e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.386e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.46e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.416e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.426e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.476e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.516e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.566e-7■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-13■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ZNF789-208ENST00000481472 411 ntTSL 415.16■□□□□ 0.023e-13■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-13■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 514.68□□□□□ -0.063e-13■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-13■■■■□ 22.4
SRSF1Q07955 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.655e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.35e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 520.38■□□□□ 0.853e-23■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 420.38■□□□□ 0.853e-23■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 516.12■□□□□ 0.173e-23■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.175e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-13■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 LIG1-216ENST00000598938 377 ntTSL 317.25■□□□□ 0.353e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MYH10-204ENST00000411957 732 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-212ENST00000588491 737 ntTSL 516.02■□□□□ 0.163e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 UBAC1-203ENST00000471163 838 ntTSL 315.48■□□□□ 0.071e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 08e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.058e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 BLOC1S5-206ENST00000627748 1273 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 FANCA-220ENST00000566409 395 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.172e-13■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 BLOC1S5-201ENST00000244777 2445 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.438e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-215ENST00000473843 598 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.538e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 511.73□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.668e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.888e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 RNF207-209ENST00000496676 3020 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.573e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 54.97□□□□□ -1.613e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.732e-8■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-213ENST00000469490 842 ntTSL 54.2□□□□□ -1.743e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.09□□□□□ -1.752e-13■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.773e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.823e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.893e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.943e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.236e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 520.42■□□□□ 0.866e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-205ENST00000447929 1983 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.26e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-213ENST00000479038 452 ntTSL 315.99■□□□□ 0.156e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-207ENST00000462371 820 ntTSL 313.88□□□□□ -0.196e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-208ENST00000465785 625 ntTSL 212.93□□□□□ -0.346e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-209ENST00000466883 2555 ntTSL 212.31□□□□□ -0.446e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-214ENST00000489482 519 ntTSL 211.76□□□□□ -0.536e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GUSB-210ENST00000475316 505 ntTSL 38.78□□□□□ -16e-9■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 520.5■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 PARP10-207ENST00000526007 2179 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.552e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 PARP10-209ENST00000527262 3027 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.15□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-204ENST00000594390 1536 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-206ENST00000596815 496 ntTSL 48.37□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.155e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.345e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.665e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.675e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.743e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 22.3
SRSF1Q07955 GIGYF1-202ENST00000464111 656 ntTSL 318.95■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 CCDC183-202ENST00000371682 1437 ntTSL 515.28■□□□□ 0.041e-13■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-13■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-13■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.451e-13■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 211.25□□□□□ -0.611e-13■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.373e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-206ENST00000508168 520 ntTSL 322.69■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-205ENST00000506561 692 ntTSL 222.69■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-10■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-208ENST00000509948 796 ntTSL 319.3■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-203ENST00000502910 714 ntTSL 318.94■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-209ENST00000514192 697 ntTSL 318.09■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 IDUA-204ENST00000504568 586 ntTSL 317.98■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 22.2
SRSF1Q07955 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 22.2
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 311.2 ms