Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC3A1Q07837 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC3A1Q07837 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms