Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP4Q07065 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms