Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX8Q06710 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms