Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DEUP1Q05D60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms