Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRB3Q04118 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms