Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPEQ02224 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPEQ02224 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms