Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
XPCQ01831 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
XPCQ01831 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
XPCQ01831 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
XPCQ01831 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
XPCQ01831 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
XPCQ01831 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
XPCQ01831 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
XPCQ01831 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
XPCQ01831 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
XPCQ01831 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
XPCQ01831 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
XPCQ01831 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
XPCQ01831 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
XPCQ01831 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
XPCQ01831 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
XPCQ01831 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
XPCQ01831 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
XPCQ01831 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
XPCQ01831 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
XPCQ01831 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
XPCQ01831 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
XPCQ01831 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
XPCQ01831 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
XPCQ01831 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
XPCQ01831 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
XPCQ01831 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
XPCQ01831 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
XPCQ01831 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
XPCQ01831 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
XPCQ01831 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
XPCQ01831 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
XPCQ01831 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
XPCQ01831 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
XPCQ01831 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
XPCQ01831 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
XPCQ01831 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
XPCQ01831 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
XPCQ01831 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
XPCQ01831 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
XPCQ01831 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
XPCQ01831 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
XPCQ01831 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
XPCQ01831 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
XPCQ01831 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
XPCQ01831 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
XPCQ01831 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
XPCQ01831 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
XPCQ01831 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
XPCQ01831 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
XPCQ01831 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
XPCQ01831 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
XPCQ01831 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
XPCQ01831 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
XPCQ01831 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
XPCQ01831 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
XPCQ01831 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms