Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFITM3Q01628 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IFITM3Q01628 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms