Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTBN1Q01082 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTBN1Q01082 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms