Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK6Q00534 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK6Q00534 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms