Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTA1P68133 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTA1P68133 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTA1P68133 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms