Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-24P63145 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-24P63145 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms