Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG7P62955 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms