Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11AP62491 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB11AP62491 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms