Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TGFB2P61812 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGFB2P61812 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TGFB2P61812 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGFB2P61812 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms