Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1BP61266 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1BP61266 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1BP61266 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX1BP61266 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX1BP61266 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1BP61266 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1BP61266 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1BP61266 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1BP61266 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1BP61266 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1BP61266 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1BP61266 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1BP61266 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1BP61266 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1BP61266 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1BP61266 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1BP61266 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1BP61266 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1BP61266 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1BP61266 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1BP61266 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1BP61266 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1BP61266 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1BP61266 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1BP61266 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms