Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVPABLB-1P60509 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVPABLB-1P60509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVPABLB-1P60509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVPABLB-1P60509 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms