Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX16P57768 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX16P57768 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX16P57768 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX16P57768 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX16P57768 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX16P57768 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX16P57768 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX16P57768 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX16P57768 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX16P57768 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX16P57768 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX16P57768 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX16P57768 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX16P57768 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX16P57768 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX16P57768 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX16P57768 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX16P57768 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX16P57768 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX16P57768 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms