Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSDMDP57764 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSDMDP57764 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms