Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L1P55209 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms