Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ELLP55199 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ELLP55199 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ELLP55199 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ELLP55199 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELLP55199 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELLP55199 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELLP55199 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELLP55199 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELLP55199 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELLP55199 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ELLP55199 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ELLP55199 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ELLP55199 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ELLP55199 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ELLP55199 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ELLP55199 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ELLP55199 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms