Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2KP53803 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2KP53803 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 375.4 ms