Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SMARCA2P51531 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.44■■■■■ 4.39
SMARCA2P51531 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SMARCA2P51531 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms