Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTPAP49638 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTPAP49638 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTPAP49638 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTPAP49638 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTPAP49638 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTPAP49638 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTPAP49638 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTPAP49638 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTPAP49638 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTPAP49638 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTPAP49638 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTPAP49638 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTPAP49638 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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