Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC11A1P49279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC11A1P49279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC11A1P49279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms